Podcast Science 341 – Les réseaux de régulation génétique

Les mécanismes de régulation biologique… sont bien complexes ! Certains de ces mécanismes biologiques sont contrôlés par ce qu’on appelle des “réseaux de régulation génétique”, dont il est difficile de comprendre la dynamique ! Mais informaticiens et biologistes ont conçu des outils de modélisation pour la compréhension. Et notre invité de ce soir, Emilien, informaticien, vient nous expliquer tout ça. Nous sommes le mercredi 23 mai, c’est l’émission 341, bienvenue sur Podcast Science !

Les images de la semaine :

 

La citation de la semaine :

Mais ton modèle, il est faux là !

Emilien, notre invité.

La Chatroom :

La Chatroom

Pascal: Salut tout le monde

nyves: salut @Pascal

nyves: ca roule?

Claire: Hello 🙂

nyves: salut @Claire

Johan: Bonsoir !

nyves: hello

Aymeric: Bonsoir à tous.

L3 G33K: Bonsoir 😁

nyves: salut @L3 G33K

Claire: @Johan t’es lààààà <3<3<3

Claire: Bon ba sinon comme tjs on essaie de regler des soucis technique, et puis on commence après

Claire: 🙂

Johan: @Claire ouiiiiiiii

Johan: Vous m’appelez ?

nyves: @Claire : You don’t say!

Johan: Alors, comment était votre Pint of Science ?

Johan: Moi j’étais a Baltimore, et j’ai écouté des trucs sur la mémoire et Alzaheimer le premier soir

Johan: et la polio et l’addiction le second

Johan: ct bien chouette

Johan: ct pas encore la folie, on était 10 le second soir

Claire: Je dis à @Pascal de t’appeler mon cher et tendre

Claire: Viens dans notre son de skype

Johan: Toujours pas Skype call

Johan: allo ?

L3 G33K: J’en ai fait 3 des soirées. Pas très remplies, mais du coup j’ai pu jouer avec les casques de VR pendant 10 minutes 🙂

Johan: Ahah

Johan: ct quoi comme VR ?

L3 G33K: Le HTC Vive Pro et un Hololens de chez Cro$oft 🙂

nyves: @L3 G33K : et? ca rend bien?

L3 G33K: L’hololens c’est classe (réalité augmentée) mais l’affichage reste très petit par rapport au champ visuel

L3 G33K: Le HTC c’est vraiment très sympa

raiateo: bonsoir tout le monde !

nyves: j’hésite a investir pour materiel de pret pour mon CE

raiateo: c’est une émission sur la chimie du café ?

Pascal: Vous nous entendez ?

Pascal: a priori oui

puyo: B’soir à tous !

Pascal: Puyo!!!

nyves: pas de live en cours

puyo: @Pascal Yeah !

puyo: J’arrive, et ça parle culotte !

nyves: apres reboot ok

Johan: Salut @puyo !

Johan: yeaaah !

puyo: Qu’est ce que ce sera dans une heure ! Héhéhéhé, moi aussi, je suis bien content ! 😀

puyo: @Johan Hourra !

raiateo: non Claire, on a rien entendu

L3 G33K: Son mp3 OK, son flash NOK

nyves: @L3 G33K : apres reboot c’ets bon

nyves: c’est calme ce soir, y a personne dans la chatroom

L3 G33K: Wai que 21

nyves: Maitresse @Claire et ses culottes

nyves: tout un programme

elfredo: Bonsoir à tous!

Johan: les gens arrivent

Claire: @nyves ca va cravacher sevère

Claire: <3

nyves: @Claire : oh oui 🙂

Cloé: Tout et n’importe quoi en biologie…? Je confirme, on en parle des cas où une molécule présente à moins de 1% dans le milieu inhibe totalement l’expression d’un gène alors que t’as mis 98% d’activateur dans ton milieu…? Tristesse…

brusicor 🔵₂: Bonsoir !

brusicor 🔵₂: (j’étais déjà en écoute, mais pas encore connecté, donc je sais que je suis pas très en retard ^^)

nyves: salut @brusicor 🔵₂

Claire: ça commence tout juste

L3 G33K: @brusicor 🔵₂ Ca a commencé à 20h40

monkey3D: bijour

nyves: salut @monkey3D

L3 G33K: bijour 🙂

brusicor 🔵₂: Donc finalement, je suis content d’être là pour la première d’Emilien.

brusicor 🔵₂:

Pascal: Salut @monkey3D

L3 G33K: Pas de train à prendre ce soir @brusicor 🔵₂ ?

brusicor 🔵₂: @L3 G33K Non, j’ai emménagé aujourd’hui. \o/

L3 G33K: Cool ! 🙂

monkey3D: ça getz par là? 🙂

L3 G33K: Je suis pas matheux mais je connais 🙂

nyves: itou

Claire: moi paaaaas muhahah

brusicor 🔵₂: Pourtant @Claire, ça doit te rappeler les cours de cinétique chimique.

Claire: même pas ^^

Claire: j’aimais bien la cinétique tiens…

Claire: la thermo bcp moins…

brusicor 🔵₂: férentielle !

nyves: @Claire : 4 de moyenne en thermo en sup 🙁

brusicor 🔵₂: (je sais, je lag un peu)

monkey3D: c l’machin quand on factorise, tout ça?

nyves: c’est clair pour moi, mais je sais ce que c’est une equa diff 🙂

puyo: Et si les renards mangent des renards ?

monkey3D: les médiétés de la fontaine

nyves: @puyo et si c’est le lapin de Sacré Graal?

puyo: Et si les goûts évoluent au fil du temps ?

puyo: @nyves Héhé, j’imagine que l’équation est vite résolue !

Johan: @puyo Si les carottes se mettent a manger des renards ?

nyves: effectivement, ca simplifie le modèle

nyves: @Johan : les carottes mutantes carnivores?

Claire: oh vuuui l’attaque des carottes tueuses

puyo: @Johan Hmmmm.. et si les carottes ne mangent que le premier mardi du mois ?

nyves: ca fait un peu nanard

Claire: mieux que les tomates avec Georges Clooney

puyo: Freud ?

nyves: @Claire : faut que je le voie celui la

L3 G33K: A propos d’images, c’est normal qu’il n’y en a pas ?

raiateo: très utilisée en chimie pour la cinétique Claire, l’équation de Michaelis Menten

Claire: aaaaah

Claire: je me disais aussi bcp je connais et pas Robin…

brusicor 🔵₂: Elles sont là @L3 G33K

L3 G33K: Ah ça y est elles viennent d’arriver

L3 G33K: Une Sigmoïde donc. A ne pas confondre avec les Slivoïdes de Magic.

L3 G33K: J’ai déjà vu ce genre de courbe en électricité/électronique, mais je n’avais jamais entendu son nom

brusicor 🔵₂: C’est moi qui suis très en retard ou @raiateo voit l’avenir ?

nyves: ca hache chez moi

Pascal: arf

raiateo: @brusicor tu dois avoir un peu de retard effectivement 🙂

brusicor 🔵₂: C’est une fonction créneau que décrit @Johan

Claire: @nyves surtout qu’il y en a DEUX

brusicor 🔵₂: La sigmoïde arrondit les angles.

nyves: @Claire : je pense qu’ils pouvaient s’arréter au premier, mais bon…

Claire: du tout, des CHEFS D’OEUVRES

nyves: 🙂

nyves: si il neige à 20°c, le climat par vraiment en sucette

Claire: attends, hier il y a eu une tempete de grelon à Paris 😉

brusicor 🔵₂: Et les chimistes utilisent aussi des orthomètres et des métamètres en plus des paramètres ?

nyves: oui, il parait. J’ai vu la photo de l’eclair sur la Tour Eiffel

L3 G33K: La grêle peut survenir même quand il fait 40 °C, contrairement à la neige 🙂

Pascal: Bonjour @Lydiane Wilfart

Pascal: (ca me fait toujours bizarre de voir une Lydiane avec laquelle je ne suis pas marié…)

Claire: @Pascal héhéhé j’y ai pensé aussi

brusicor 🔵₂: Tu es prévenue @Lydiane Wilfart, attention à ne pas te marier avec @Pascal

nyves: @Pascal : t’es marié avec beaucoup de Lydiane?

nyves: 🙂

Johan: Ya que moi qui recoit des updates des conditions de protection des données des utilisateurs de tous les sites ou je me suis inscrit depuis 10 ans ? La loi a changé ?

nyves: @Johan oui : RGPD

Claire: Surtout que @Pascal peut être flippant quand il veut… (oui @Pascal, j’ai REREREREREgardé LA photo il y a peu… j’ai RIS) <3

L3 G33K: @Johan J’en reçois régulièrement aussi

Johan: @nyves Da’ccord je vais lire ca

Pascal: @nyves une seule, mais je n’en croise pas beaucoup)

brusicor 🔵₂: Tu as raison, c’est très utile un rapporteur, on peut poser plus de questions qu’à une équerre.

Johan: j’en ai recu 10 en 2 jours je crois

nyves: Toute société travaillant avec des données européennes doivent être compatible avec la RGPD

Pascal: Tu devrais encore en recevoir

L3 G33K: 2nd point PodcastBlague pour @brusicor 🔵₂ ^^

nyves: je confirme, c’est un joyeux bordel la RGPD

nyves: personne n’est franchement pret

Pascal: toute boite qui gere des données te concernant est censé te demandé l’autorisation de continuer a le faire avant Vendredi

nyves: @Pascal : oui, c’est pas un prénom courant

NicoTupe: @nyves personne n’est prêt et ce qu’il faut faire n’est pas clair

nyves: je confirme

NicoTupe: il manque un peu une définition de “données personnelles”

NicoTupe: dans le cadre B2B, c’est le flou absolu

brusicor 🔵₂: @nyves “Courant” est plus un nom qu’un prénom. Fred Courant par exemple.

nyves: y a mm des spécialité d’avocats RGPD qui sont entrain de se monter

Pascal: Et le truc qui est sympa, c’est que tout les sous-traitant de tout le monde s’en occupent depuis 1 mois et transmettent les infos au dernier moment

nyves: @brusicor 🔵₂ : C’est juste 🙂

nyves: en plus, quand tu sais qu’aucun projet ne prévoit ses purges avant que les disques soient pleins…

nyves: y en a qui sont en mode panique

nyves: j’ai bossé pour un client qui stocker 10 ans de ticket de caisse dans une base 🙂

Pascal: en gros, nous le monde sera GDPR-compliant dans 10-15 ans…

L3 G33K: @nyves mardi j’ai reçu un mail de la direction demandant de faire du tri dans les boîtes mails, les disques durs du serveur mail étant plein ras la gueule

NicoTupe: et d’ici là il y aura la GDPR2

nyves: c’est ca

L3 G33K: Y restait 700 ko sur les 450 Go

Pascal: d’ailleurs, dans mes 15 ans de mails de ma mailbox, il y plein de données personnelle

nyves: @L3 G33K : ah oui qd mm

Pascal: et de meme pour mes collegues

nyves: apres, 450 Go c’est que dalle 🙂

nyves: ‘oui, je bosse dans le big data, je me la pete)

L3 G33K: @nyves Yep, pas énorme mais pour 300/400 personnes c’est déjà pas mal. Mais oui comme d’hab ils attendent le crash pour agir

nyves: @L3 G33K : sinon c’ets pas fun. Mais t’inquiete, ils sont tous comme ca, de la PME a la boite internationale

L3 G33K: En plus on est en POP avec suppression au bout d’un an

brusicor 🔵₂: A chaque cas son k

nyves: @L3 G33K nos boite sont limitées à 500Mo/pers.

nyves: vu le nombre de amil qu’on recoit on archive souvent

nyves: Smoothie fraise?

puyo: MMmmm.. les contraintes de smoothies !

L3 G33K: Chez nous, dixit l’informaticien “passer les boîtes en IMAP c’est trop compliqué” lol

nyves: 🙂

Claire: @puyo j’ai pensé la même chose <3

Claire: tu crois que je développe un esprit de dessinatrice ? Hiiiiiiiiiii <3 😉

Pascal: @Claire depuis 2 mois, tu es clairement la dessinatrice n°1

nyves: on attends le dessin de smoothie @puyo 🙂

Claire: @Pascal ptete qu’à partir de 6 mois je saurai dessiner autre chose que ma tête de fille ^^

nyves: Au fait, j’était pas là, mais l’anthropologie génétique, c’etait juste génial!

puyo: @nyves J’ai un dessin sur le feu 😀

nyves: cool

L3 G33K: @puyo cool 😍

puyo: @Claire Ho, certainement ! Et cela traduit un esprit fort élaguant!

Fred Conrotte: coucou tout le monde !

Fred Conrotte: ca fait un bout de temps que je suis plus passé dire bonjour 🙂

puyo: @Claire Heu.. élégant plutôt ?

nyves: salut @Fred Conrotte

L3 G33K: bonsoir 🙂

Claire: Hello 🙂

Cloé: bonsoir

Claire: @puyo <3

Fred Conrotte: je vais faire mon lèche botte mais j’aime bien la fraicheur que Claire apporte à PS

Cloé: Et on en parle des gènes que t’essaie d’exprimer en mettant la dose d’activateur dans ton milieu mais qu’ils sont quand meme ihnibé parce que ton produit n’est “que” 99% pur et qu’il contient 0,01% d’inhibiteur…?

Cloé: inhibés*

Cloé: Si y’a un modèle pour expliquer ça, je suis preneuse…

Claire: @puyo d’ailleurs en ce moment je me penche bcp sur le dessin et dessin “sur ordi”, tu conseillerais pas des cours/profs/logiciels/formation ?

Claire: @puyo yeaaaah <3

L3 G33K: Joli dessin @puyo 🙂

puyo: @Claire Ho, c’est chouette ! J’ai des pistes pour toi !

nyves: bien @puyo

puyo: Merci merci ! 😀

Claire: quizz bonus du soir : combine de sigmoides dans le dessin de @puyo ? 🙂

puyo: ^^

Claire: combien*

Cloé: “C’est difficile de parler avec les biologistes”. C’est presque vexant…^^

puyo: @Claire Je n’ai pas vraiment de pistes pour les cours, mais je peux te donner des éléments pour les logiciels et la pratique

Claire: @puyo génial ! On en papote par mail ? Ou sur slack ?

puyo: @Claire ce que tu préfères !

Claire: Suis trop contente 😉

puyo: @Claire <3

Claire: j’ai demarré une conversation sur slack 🙂

puyo: Yeah !

nyves: @Claire : fait gaffe tu devient geek

brusicor 🔵₂: Emilien qui veut essayer de nous faire croire que les informaticiens travaillent sans souris…

Claire: Naaaan, je veux dessiner mieux, voilà tout 😉

Claire: @brusicor 🔵₂ muhahaha

L3 G33K: @brusicor 🔵₂ Mouarf excellent ^^

nyves: @brusicor 🔵₂ : ca dépend, les lunixiens et les coboleux travaillent souvent sans souris 🙂

L3 G33K: e-coli tout le monde connaît je pense vu le buzz que ça a fait dans les médias il y a quelques mois

brusicor 🔵₂: Problématique, j’appelle ça un chien personnellement.

nyves: bien @brusicor 🔵₂

L3 G33K: @ps en gros si la bactérie pète le feu, le virus va pomper ses ressources sans vergogne ; et si elle est faiblarde il va s’associer à elle pour y aller “mollo” ?

Cloé: Yeap

Blue Phenix: Bonsoir méga à la bourre à tous x)

nyves: salut @Blue Phenix

L3 G33K: slt @Blue Phenix

Pascal: A noter que j’ecris Cronembourg avec un C

Pascal: (parce que le quartier strabourgeois m’interesse plus que ce truc que certains osent appeler “biere”)

Blue Phenix: ça a commencé méga en retard ou j’ai pratiquement tout raté ? ^^

nyves: de toute facon, c’est pas vraiment de la biere, la Kro

Cloé: ça a commencé presque à l’heure :/

nyves: @Blue Phenix : t’a raté bcp de chose

L3 G33K: 20h40 @Blue Phenix

Blue Phenix: arf x) le pire c’est que j’écoutais un autre épisode en podcast x) je viens seulement de réagir qu’on est mercredi ^^” bon bah j’écouterais en podcast alors ^^”

Claire: héhéhé

Blue Phenix: bon bah je vais vous laissez pour pas me spoiler ^^ bonne soirée à tous !

nyves: ciao

Pascal: Salut

L3 G33K: ++

brusicor 🔵₂: J’attends avec impatience l’exposé au Palais sur le sujet.

brusicor 🔵₂: Est-ce qu’on finit par admettre les paramètres ?

L3 G33K: Le point Kronembourg” ^^

L3 G33K: Déjà avec le dessin c’est chaud patate, alors ceux qui ne l’ont pas…

brusicor 🔵₂: Ce n’est pas un schéma, C1 plan sans à Cro !

nyves: @brusicor 🔵₂ bien!!!!

L3 G33K: 3ème point BlaguePodcast pour @brusicor 🔵₂ 🙂

L3 G33K: J’en connais qui lorsqu’ils ont trop de Kro se retrouvent auto-inhibés aussi ^^

Claire: muhahahaha

brusicor 🔵₂: Et 1 point BlaguePodcast pour @L3 G33K !

Pascal: “Trop de Kro”, c’est une seule, non ?

L3 G33K: 😍 @brusicor 🔵₂

nyves: @Pascal : il parait

L3 G33K: @Pascal ^^

nyves: ca a le même effet sur ma femme que l’eau bénite sur un démon 🙂

brusicor 🔵₂: Attention, si vous énervez trop Emilien, il va montrer les Kro.

Pascal: Ca fait ca a a peu pres toute personne qui apprecie la biere

L3 G33K: 4ème point BlaguePodcast pour @brusicor 🔵₂ 😇

brusicor 🔵₂: @ps A quand l’exposé au Palais sur le sujet ?

nyves: on en revient à la question “est ce qu’un bon vulgarisateur doit etre un bon connaisseur du sujet”

brusicor 🔵₂: Oui, dans le sens qu’il doit connaitre plus que ce qu’il transmet durant l’exposé

L3 G33K: Oui c’est bon j’ai bien assimilé le truc sur ce point 🙂 @ps

nyves: cooooool!

L3 G33K: Ca va donc être sale ^^

nyves: là, il fait sec, et j’ai mal

nyves: mais implication n’est pas équivalence

L3 G33K: Moi j’ai pas mal, ni quand c’est sec ni quand c’est humide

L3 G33K: (ni dans la piscine)

nyves: oui, mais toi t’es jeune

nyves: 🙂

L3 G33K: Yep 🙂

L3 G33K: @ps Pour le Patreon c’est bon pour moi du coup c’est relancé 🙂

nyves: Après 40 ans, quand tu te leve et que tu as pas mal, c’est que tu es mort 🙂

brusicor 🔵₂: Ça doit être les géologues du Palais avec les exposés sur le cycle de l’eau qui doivent être content !

L3 G33K: @nyves Plus que 5 ans alors à attendre…

Pascal: 1 an et 8 mois…

nyves: -8 ans 🙂

L3 G33K: 4 ans 7 mois et 1 jour précisément pour moi 🙂

nyves: mais 22 ans d’age mental 🙂 et encore dans les bons jours

Pascal: (a noter que j’etait au jour pres)

L3 G33K: ^^

brusicor 🔵₂: @ps Est-ce qu’on ferait pas un rappel que mercredi, juste avant PodcastScience, il y a “UFO Life” avec les élèves de Taupo ?

brusicor 🔵₂: Le site de l’événement : http://bionum.univ-paris-diderot.fr/category/billets-de-blog/

Pascal: “tout les modele sont faux, certain sont utile” que Lê sort tout va

nyves: “il ne faut pas croire toutes les citations d’internet” einstein

brusicor 🔵₂: A partir de 15h30 à l’amphi Buffon (15 rue Hélène Brion 75013 Paris)

L3 G33K: Faut que j’essaie de ramener Antomologie ici alors mercredi prochain 🙂

brusicor 🔵₂: En même temps, on ne va pas faire l’annonce du mercredi aprem le mercredi soir. ^^

nyves: oui, j’ai entendu ca sur un podcast

L3 G33K: J’ai même vu qu’elles prennent du plaisir quand elles éjaculent les mouches @ps

brusicor 🔵₂: Mais grâce à Emilien, j’aurai de nouveau jeu de mots à base de “cycle cata-lytique”

nyves: si vous connaissez pas, je vous conseille les podcast de Radio Canada

Pascal: Bonne nuit tout le monde

puyo: Bonne nuit à tous !

L3 G33K: BN tlm

nyves: y en a des tres bons

brusicor 🔵₂: Bonne nuit, les petits !

nyves: bonne nuit

L3 G33K: 😴

Cloé: Bonne soirée, et merci pour ce sujet =)

nyves: a la semaine prochaine

nyves: oui, merci pour le sujet

Johan: Bonne nuit !

Johan: Merci

elfredo: Bonne Soirée! C’etait une bonne emission!

Claire: Bonne nuit 🙂

monkey3D: bn!

 

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